Kiểm soát thứ tự ưu tiên đầu tư là việc kiểm soát danh mục các dự án tiềm năng ở tầm chiến lược. Đây là công việc rất quan trọng trong kiểm soát dự án đầu tư. Nguyên tắc là các quyết định đầu tư phải gắn liền với việc hiện thực hóa hệ thống các mục tiêu chiến lược đã xác định.