Cơ quan chuyên trách là hình thức tổ chức thẩm định mà người có thẩm quyền quyết định đầu tư sẽ sử dụng cơ quan chuyên môn có chức năng thẩm định đầu tư hoặc quản lí hoạt động đầu tư của đơn vị mình tiến hành thẩm định trước khi ra quyết định đầu tư.